为了成为合格的神奇宝贝训练师，小智（松本梨香 配音）、天桐（宫野真 配音）、艾莉丝（悠木碧 配音）带着各自的小伙伴继续在世界各地旅行。这次他们来到了美丽的山中小镇艾茵多奥克参加神奇宝贝的比赛，在比赛的时候，小智多次得到一个神秘的小家伙的帮助。他的反常举动引起了当地的美丽女孩卡莉塔的注意，最终众人发现，那个帮助了小智的家伙就是传说中拥有神奇力量的神奇宝贝比克提尼（水树奈奈 配音）。 早在一千多年前，艾茵多奥克所在的土地上有一个美丽富饶的大地之乡，可是两个王子的争斗摧毁了这个国家的宁静。老国王借助比克提尼的力量暂时稳定住了龙脉，而大地之乡则从此衰败。作为古国的后裔，卡莉塔的哥哥德雷多（つるの剛士 配音）决定依靠比克提尼重建大地之乡……
家族大企业市之宫集团计划将荒川河附近的大片土地开发，建成高档住宅区。该集团社长市之宫积（上川隆也 饰）严肃强势，他命令自己的儿子——毕业于名牌大学的精英大学生阿行（林遣都 饰）想办法遣散赖在当地不走的顽固分子。阿行信心满满，可是刚到荒川河就遭三个打扮怪异的人打劫，裤子被扔到桥的上面。关键时刻，自称来自 金星的美丽女孩小珊（桐谷美玲 饰）帮助了阿行，并救了他的命。秉承着“决不欠人情”的家训，阿行执意报答小珊，小珊则要求和他谈一场恋爱。此后的日子里，阿行住进了这个只有13个人却净是打扮奇特的怪人的川地村。在与他们碰撞和相处的过程中，阿行固有的想法渐渐发生转变…… 本片根据中村光的同名漫画改编，是TV版的电影剪辑版。
