日高梦见（相泽舞 配音）是一个平凡的少女，在她的内心深处隐藏着一个不为人知的的秘密，在广阔无垠的天空之中，梦见有时能够看到不可思议的岛屿漂浮其中，然而，能够看到此番景象的，似乎只有她一人。 某日，一位名叫穆恩特（小野大辅 配音）的红发少年突然出现在了梦见的面前，原来，这个世界分为“天上界”和“地上界”两个部分，而穆恩特就来自于天上界的魔导国。长久以来，一股奇妙的力量维系着两个世界的平衡，维持着两个世界的运转，如今，这股力量渐渐枯竭，天上界因此而陷入了混乱，照这样发展下去，迟早有一天，灾难会波及地上界，而梦见，就是拯救这一切的唯一人选。
八坂一（三瓶由布子 配音）是一位热爱科学的平凡少年，他坚信世界上的一切都可以用科学解释。然而，某一日，八坂一邂逅了名为岚山小夜子（白石凉子 配音）的神秘少女，她的出现以及随后而来的不思议事件颠覆了八坂一的全部世界观。 两人的相遇令他们获得了穿越回过去的特殊能力，与此同时，女扮男装的上贺茂润（小见川千明 配音）、同样拥有穿越时空的能力的德国少女可雅（名冢佳织 配音）、一直追随着小夜子的墨镜男村田英雄（安元洋贵 配音）、痴情而又倔强的山崎加奈子（堀江由衣 配音）以及身世神秘的少女伏见弥生（野中蓝 配音），这些角色接二连三的出现在八坂一的身边。
在私立莉莉安女子学院里，有着这样一个制度，新入校的学生要选择一位高年级的学姐，两人结为“姐妹”，在校学习的期间，姐姐将全方位的照顾教导妹妹的生活礼仪。在学院里，山百合会的名字如雷贯耳，作为会长的小笠原祥子（伊藤美纪 配音）、鸟居江利子（生天目仁美 配音）和佐藤圣（封口惠美 配音）三人更是学院里女生们倾慕的对象。她们被称为学院的三朵蔷薇，平日里，她们和她们的妹妹，也就是蔷薇花蕾管理着学生会里的大小事宜。 平凡的少女福泽佑巳（植田佳奈 配音）在误打误撞中成为了祥子的蔷薇花蕾，同时也肩负起了管理山百合会的重任。在和其他花蕾相处的过程中，又温馨又轻松的校园生活开始了。
从各个方面看来，就读于白城学院高中部的绫濑裕人（羽多野涉 配音）都是一个极其普通的男生。长相普通、成绩普通、运动普通，甚至于对女孩子的品味也很普通。因此，当同班同学兼校园偶像的超完美大小姐乃木板春香（能登麻美子 配音）出现在他的面前时，裕人并未被春香的魅力所折服，正相反，他觉得这个各方面都十分优秀的女生总是有种说不出的怪异。 裕人的直觉十分敏锐，在一次偶然中，他发现了春香的秘密。原来，这个外表高贵的千金居然是一个不折不扣的御宅族，而春香和她那一拨古怪的朋友们的兴趣，居然是制作魔法少女相关的同人作品！这个秘密迅速拉近了春香和裕人之间的距离，也开启了属于他们的浪漫情缘。
とある魔術の禁書目録たん Blu-ray&DVD初回予約特典ディスクに収録のおまけアニメ。 原作の出版社やアニメの制作会社が同じことから『しゃくがんのシャナたん』同様、ちびキャラ化したインデックスことインデックスたんをはじめ、各登場キャラクターたちが繰り広げる公式パロディ作品である。基本的には本編のパロディだが、『しゃくがんのシャナたん』のものまね（「とある魔術の座談会2」にて、ものまねについての言及がある）や出演声優に関するネタ、さらには出演声優による地の会話などが加えられている。この他、テレビアニメのプロモーションでコラボレーションを行った『とらドラ!』や『俺の妹がこんなに可愛いわけがない』、制作会社繋がりの『探偵オペラ ミルキィホームズ』やネット上でネタになっていた二期OPや、さらには『侵略!イカ娘』『リングにかけろ』などのパロディや外伝作品『とある科学の超電磁砲』の宣伝などもネタにしている。なお、インデックスたんは後に『しゃくがんのシャナたん』への出演も果たしている。『とある魔術の禁書目録たん3』ではシャナたんと同じ声優繋がりであるアニェーゼもちびキャラ化しており、更に作中シャナたんを髣髴とさせる発言を行っている。
2008年4月より放送され、多くの謎を残したまま衝撃的なクライマックスを迎えたTVアニメ『ドルアーガの塔～the Aegis of URUK～』。その続編となる第2期シリーズ『ドルアーガの塔～the Sword of URUK～』が、2009年1月より放送開始となる。 本作は原作となる『ドルアーガの塔』から80年後の世界。神も英雄も存在しない、混沌とした世界を舞台に、巨大な塔の中で繰り広げられる冒険の数々……。誰にも想像できない、型破りな新約ファンタジーが重厚かつ壮大なスケールでふたたびはじまる。前作で人気を博したキャラクターたちはもちろん、新キャラクターも多数登場。主人公・ジルをはじめとするキャラクターたちの成長と闘い、そして物語の結末がついに描かれる……。
