故事發生在被選召的孩子們首次接觸數碼世界的6年後。2005年的一天,東京港區海面上的波浪在朝陽下搖曳……17歲的高中生八神太一,如常地用手按停眼前的鬧鐘,踢開混亂的被鋪,低聲滴咕下伸展四肢。拉開了窗簾,光線照到桌上一幅「那一天」的集體照上。隨後他在「一路順風,哥哥」的送別聲下,騎上腳踏車出門,奔向那片初夏的青空……現在,冒險再度進化……
黄土荒村生存不易,十岁男孩沃土的父亲出外打工,留下他与爷爷、妈妈和妹妹在老家简朴度日。羡慕同学们都有酷炫的水枪,沃土总盼着父亲回家能记得给他带上一把,却总是失望。自知不久人世的爷爷向他保证,当他成为鬼魂,一定会设法满足乖孙的愿望。爷爷离世后,沃土果真在梦中遇见爷爷,然而,爷爷穿越生死时空所带回来的讯息,却意外给家人们带来了一场风暴……。