在灵气复苏、全民修真的蓝星，李凡尘为替父亲偿还一亿高利贷，被迫进入峨眉女子学院。初入校园，他以未知层级的炼气期修为遭人嘲笑，却意外与南宫珩结下渊源。炼丹大赛上，他用大铁锅炼出九转造化丹惊艳全场，不仅赢得比赛，更让对手履约道歉；青云森林的狩猎任务中，他误惹雷狱麒麟又逢尸骨大阵，凭借神兽威慑化险为夷；面对魔教金苍的突袭，他手持锄头秒杀强敌，却没能阻止南宫珩被教主掳走。最终，李凡尘选择留在学院坚守正邪战局，成为峨眉女子学院史上首位大师兄，开启全新修真之路。
藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了赛车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。
