本剧改编自清水玲子所著同名漫画，以科学警察研究所的法医第九研究室，通称“第九”为舞台，利用特殊的MRI技术再现死者的生前记忆。拥有罕见容貌、惊人记忆力和敏锐洞察力的薪刚（板垣李光人 饰），是第九的创始成员兼室长。由于某个事件，既是好友又是同事的铃木克洋（中岛裕翔 饰）去世了，在薪的面前，被分配到了一模一样的新人搜查员青木一行（中岛裕翔 饰）。两人看到了死者直到临终都隐藏着的“想法”和“秘密”，虽然心中抱有罪恶感和纠葛，但仍为解决难案而奋斗，成为无可替代的搭档。
1928年6月4日凌晨，日本关东军为了侵占我东三省，指使敢死小分队化装成“东北军”，在奉天三洞桥炸毁了大军阀张作霖的专列，爆发了震惊中外的“皇姑屯事件”。但令日本人万万没有想到的是：这个绝密的行动恰巧被一个中国姑娘连海华看了个一清二楚。连海华不但看见而且还拿到了直接罪证：这次行动的特别命令。为了不让这个目击者泄露出事件真相的秘密，日本关东军最高司令部下了死令：务必尽快将其抓住灭口！这个任务落在被号称为关东军“间谍之花”的樱川丽子的头上。樱川丽子不敢怠慢，立即展开了对连海华的一系列追杀。
世纪之交的老北京城，巍巍大清气数将尽，苟延残喘。各方势力相继抬头，救国救亡的队伍中各类投机分子时隐时没。老北京城的一个角落里，王利发（陈宝国 饰）经营的裕泰茶馆见证着时代每一个席位的变化，更收纳了汹涌大潮之下多姿百样的平凡众生相。没落势力的庞太监（张惠中 饰）、松二爷（ 石小满 饰），紧抱时代大腿的宋恩子（梁天 饰）、吴翔子（刘惠 饰），以民族救亡为己任的秦二爷（谢刚 饰），生活在底层的社会渣滓刘麻子（崔杰 饰）。三教九流，世间百态，汹涌的历史洪流之中，一出令人唏嘘不已的悲喜剧……
一年前，施世纶(欧阳震华饰)的两位妻子丽舒、香蓉和子女遇到船难身亡，自此改变了他的人生观，决定过悠闲日子，带著母亲赵月娥(李枫饰)与元配庞葛爱(吕珊饰)及二太贾秀玉(姚莹莹饰)到仙游县游玩，结果与新的枕仙(李思捷饰)结缘，还找到生命中另外两位妻子吴君柔(宣萱饰)及陆小蝶(唐宁饰)
上世纪六十年代，老艺术家王心刚和田华主演的电影《秘密图纸》风靡全国，给很多人留下了深刻的印象。目前，这部红色经典力作被再度改编成电视剧，由金盾影视、广州电视台、上海文广新闻传媒集团以及北京安平投资有限公司联合出品。 边防某部作战参谋陈亮的前妻去世多年，如今陈亮和身为公安的妻子石云一起照顾着他和前妻所生的儿子毛毛。 特务组织要派年仅27岁的黑桃Q回大陆组织一次特别的特务行动，回来之前他专程去了趟日本，用毒酒毒死了把他带入特务行当的干爹。黑桃Q游回大陆，一上岸直接被抓捕。石云提审黑桃Q，黑桃Q叫出了石云的原名“肖流云”，石云大惊。之后，黑桃Q便在监狱中食物中毒死亡……而此时公安局截获了特务的密电码，破译后只有四个字，“秘密图纸”…………
