继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
天生绝脉、废体少年——凌霄，一朝逆袭，修成悟道神体，为救爱人、为寻父母，为护苍生，战天斗地，打穿三千世界，使人族三界，乾坤逆转，挣脱秩序掌控者的束缚，重塑三千世界崩坏的秩序大道，再造人族无上辉煌！
带着上一世满级盗贼的记忆，回到三年前，这是命运给凌策的考验还是赏赐？既然重生，那上一世未曾达到的、不能守护的、那些只能幻想的，这一世全都要。更以巅峰造极之态，摧枯拉朽之势，超越极限，成为最强“觉醒者”。
