《康熙微服私访记3》沿袭前两部借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“锦袍记”、“食盒记”和“铃铛记”三个单元故事组成。“锦袍记”中康熙（张国立饰）派大太监三德子（赵亮饰）回故里调查贪官一事，然而当牵扯进亲情之后事情开始变得难以取舍；“食盒记”由宜妃（邓婕饰）的亲戚噶礼送的食盒引发；而在“铃铛记”中，康熙竟然独身离宫，当起了普通老百姓。
孝明年间，山河动荡，武林黑暗。隐姓埋名的侯府公子左卿辞，以江湖游医身份，在两月之期内，寻找一卷遗失的山河图，由此结识了易容盗贼飞寇儿。飞寇儿背景神秘，为给师父苏璇盗药不慎曝光身份，竟是正阳孽徒——苏云落。 正阳掌门金虚真人号令武林，抓捕苏云落。左卿辞为救苏云落，不惜身陷江湖风波。此时危机频发，侯府满门遭到权臣威宁侯陷害，左卿辞不得不卷入家国乱局。苏云落与之一同抽丝剥茧，翻出一段江湖秘史，更由此牵连出一段十年前的朝堂真相。 江湖相知，庙堂对峙，一为光明筑道，一为黑暗破局。 他与她明明触手可及，却永隔一寸相思......
故事发生在战国末期，此时秦国不断强大，大有吞并天下的气势。饱受秦国碾压的赵国，生活着一个家破人亡的可怜女子李皓镧（吴谨言 饰）。在颠沛流离、无依无靠之际，她被大商人吕不韦（聂远 饰）买下，尽心调教，遂出落得亭亭玉立，光艳迷人。此后不久，吕不韦将皓镧献给了在赵国当人质的秦王孙嬴异人（茅子俊 饰）。赵国公主雅（海铃 饰）爱慕异人，因此对吕不韦和皓镧百般陷害。长平之战后，吕不韦出谋划策为异人铺路，帮其重返秦国，成为了秦王的继承人。一入宫门深似海，况且在全国大一统的前夕，连秦国上空都漂浮这令人不安的气息。 皓镧这样的女子，注定要用生命见证着一段流传千古的传奇……
