东西冷战了170年后的未来，世界被分为东部和西部二个对立面。经常互相对峙，处于极度的紧张状态。在那样的状况中，设立了秘密谍报组织“Zero zero机关”，组织以00号码称呼着间谍部队中的人工控制机械人。 主人公ミレーヌ·ホフマン 属于00号码间谍“9小组”的女性人工控制机械人。代号009-1的她美丽的身体中包藏着许多秘密兵器，并赌上性命进行着谍报活动。
自卑、胆小，还有严重的选择困难症，这些让叶小暮生活得并不幸福，一次向喜欢的男生告白失败后，小暮震惊的发现自己有了可以穿越到平行世界的能力，那个世界男神爱她、生活幸福，一切都很好，沉浸在那个世界的同时，小暮却逐渐发现了某个惊人的秘密。
娆疆一行归来，李嗣源已称监国，借天子之名四处绞杀不良人，而身为天子的李星云也即将面临一个新的选择……
