2002年，数码世界面临灭亡的危机！数码世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃…… 古代曾经拯救数码暴龙世界的十斗士现在已不存在。就在这危急关头，十斗士的斗士精神把新力量给予了另一个世界——现实世界的孩子…… 主角拓也等人，将进入数码世界，变身成数码暴龙，投入这场冒险与战斗的旅程！
黒の地平を旅立ち、 次の大陸めざし航海していたビィトたちは 新たなる敵『魔牢獄の獄長バウス』の攻撃をうけ、 地図にのらない幻の大陸に漂着する。 そこには、 天撃を使う人々の暮らす町シャンティーゴがあり、 ビィトたちは暫くこの町で暮らすことになる。 シャンディーゴの領主の息子であるリオンは バスターになることを嫌い、 いつも、家出のチャンスをうかがっていた。 そんなリオンと出会ったビィトたちは リオンが秘めている謎の力、天力陣に助けられ バウスのあやつる囚人ヴァンデルたちと激しい闘いを繰り広げる。 リオンに興味をもつバウスの狙いとは？？ リオンのもつ力とは？？ ビィト戦士団とリオンの出会いが新たな冒険の扉を開く！！
在某个城市中存在着不为人知的被称为Amazon的吞噬人类的异形的存在。它们的数量，竟达到4000只。制造出这个怪物的元凶正是野座间制药公司！命令名下的野座间Peston Service驱除班秘密处理“Amazon”。 就是在这种情况下，在清洁干净的房屋中一步也不出去的平稳生活着的青年水泽悠和只靠野生的直觉和战斗力的像野兽一样的活着的男人鹰山仁相识，慢慢懂得了在“Amazons”的激烈的生存斗争中生存下去的故事。
神山高志（樱井孝宏 配音）是一个看上去非常平凡的普通青年，却在误打误撞之中进入了克罗马帝高校就读。克罗马帝高校在当地臭名昭著，号称是坏人的巢穴，犯罪分子的摇篮，在这里，手无寸铁身形瘦弱的神山会遭遇怎样的经历呢？ 表面看似是超级凶狠的不良少年，其实却意外的有家教的林田慎二郎（铃木琢磨 配音）、拥有高强战力，却无法阻止同学们到自己家里聚会的前田彰（稻田彻 配音）、无论以哪种方式看都是机器人，但却并不知道自己是机器人的机械泽新一（若本规夫 配音）、克罗马帝高校的王竹之内丰（内藤玲 配音），很快，神山就结识了一帮志同道合的“朋友”。
