知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人计划正被精心设计。
在金融財政的諜對諜世界裡，有很多上流社會人士，各種權力鬥爭都攸關生死。Thomas的事業如日中天。眼看公司最賺錢的交易即將到手，他竟陷入了一座充滿欺騙的迷宮裡。
影片以一场神秘的追杀拉开序幕，张孝智（彭禺厶饰）、钱眼儿（何其炜饰）、禾苗（曾妮饰）三人驱车逃命，无缝衔接《宝塔1》，不料汽车坠入山崖，禾苗中枪被炸身亡，孝智与钱眼被救于虎水镇，结识了金国后裔完颜洪，完颜洪为获得黄泉妖龙的法力，让女主八角（戴安娜饰）欺骗孝智地宫中的神龙盘可将阴间之人召回，孝智为复活禾苗，决心前往地宫，一个接一个的陷阱也接踵而至。
