精灵梦叶罗丽第三季

　　城市中出現了來歷不明的光病毒。SRC中的Eyes隊成員為要確認光源搜尋至鏑矢島，遇上了對怪獸充滿愛心的預備飛行員春野武藏。此時，光病毒入侵怪獸力特里亞斯體內，力失控，Eyes準備向力發動攻擊，武藏決要阻止，危急中，超人高斯終於回來。

　　神崎堇因为灵力丧失决定退出花组，回到神崎重工。

　　第一幕「华都花之军」
　　太正８年的春天，为了应付即将爆发的降魔之战，帝国陆军的米田一基提案组织帝国华击团，而藤枝菖蒲则奉命前往世界各地寻找能够成为队员的超能力者。此时，真宫寺完全不知自己的命运即将改变，仍在故乡仙台持续练习着剑术…。
　　第二幕「在樱花中展放吧，神剑」
　　为了保卫帝都不受降魔的侵袭，红兰、玛莉亚、环奈、爱莉丝等四人在总司令_米田的号召下，加入了帝国华击团。然而，等待着他们来挑战的并非军事训练，而是为了能登上「大帝国剧场」的花舞台，所进行的舞蹈及发声练习；原来这是米田为了隐藏帝国华击团的存在而想出的奇特点子。接着，帝国华击团为了补强战力，找来了神崎重工会长的孙女—菫加入阵容，但因为菫的态度非常高傲，使得环奈对她十分不满，好不容易就要建立起来的团队默契，眼看着又陷入了撕裂的危机…。另一方面，真宫寺樱决定前往东京，她在出发前得到了一本记载着真宫寺家祖传的北辰一刀奥义流的书卷，樱是否能领悟出这本奥义中所记载的剑术呢？
　　第三幕「春天三月，首次登场」
　　帝国华击团在经过一番波折后，终于正式开始运作，而花组的成员为了消灭徘徊于帝都的降魔，也展开了一连串的作战。此时，大帝国剧场的舞台揭幕了，用来掩护华击团的另一个身分——「帝国歌剧团」，其公演也陆续开始。樱虽然顺利加入了帝国华击团，但却在驾驶光武的演习中发生失控，导致她只能在舞台边落寞地欣羡玛莉亚等人的演技，此刻花组的其它成员也无法接受樱的加入，队内气氛顿时变得很僵。身兼队长的玛莉亚由于无法负荷每天的密集行程，于是向菖蒲提出了卸下队长职务的要求。某日，玛莉亚在目睹樱独自练习唱歌的情景后，觉得樱拥有很大的潜能，于是决定让她在下次的公演登场，可是菫却对玛莉亚的这项决定感到非常不满，因而大发雷霆…。
　　第四幕「仲夏梦之夜」
　　历经数场的战役之后，花组队长大神一郎渐渐地得到其它队员的信赖。不过，大神为了应付这几个非常有个性的队员，每天都费尽了心思，身心的疲惫也因此达到了最高点。某天，当大神在执行夜间巡逻任务时，凑巧看见独自一人在练习剑术的樱，大神对樱说：「我很羡慕你们能够为人们带来梦想」；其实樱最近早就觉得大神很没精神，在听到这番话之后，为了激励大神，于是反过头来要求他企划一场由花组全体登台表演的歌剧。这场由大神负责指挥的歌剧是否能顺利演出呢？

　　主角有马拓也为一个无所事事的高中生，他父亲是历史学家，却在研究时失踪，留下他与继母两人相依为命。暑假时主角收到父亲寄来的包裹，里面有一个罗盘和三颗水晶珠，以及一封写着「时间是可逆的，历史是不可逆的」云云以及一些关于平行世界概念的信，并交待主角晚上去当地有名的地标剑之岬去见一个人。
　　拓也晚上如约来到剑之岬，发现自己的继母亚由美和父亲研究夥伴龙藏寺幸三都在场。原本和蔼的龙藏寺突然翻脸要有马把收到的邮包交出来，并拔出枪来威胁他，千钧一发之际，一道闪电落下劈在了神社的御神石上，拓也就此晕去。等拓也甦醒过来周围已经旁无一人，回家睡了一觉后才发现不对劲。继母和龙藏寺完全不记得昨晚发生的事情，此时他才发现原来父亲寄给他的遗物是可以让人在平行世界自由穿梭的神奇道具，于是他为了找到父亲真正的下落展开了一系列调查。

时值19世纪，在英国名门贵族凡多姆海伍家，有一位神秘、优雅、十全十美的执事，他就是“黑执事” 塞巴斯蒂安。虽然塞巴斯蒂安总是淡淡地说： “我只是一名执事罢了”

　　千万年来，古老而神秘的龙族在中土大陆繁衍生息。然而，神界的光魂与暗魂之争，也将龙族牵连其中。龙族陷入残酷的内乱，甚至面临灭族之危。绝望时刻，出走已久的东海王子敖雪强势归来，欲解救龙族于危难之中。

　　自西元20XX年，人类从肯亚图尔卡纳湖的湖畔挖出了一个名叫索哈尔(Zohar)的物体之后，便开始对它进行研究，后来有人重建出来所谓的“神之语言”，并建立电脑程式以启动原始索哈尔，进行和上位领域的U-DO(上位领域当中的红色波动存在)连结的连结实验，但很不幸地，从上位领域流入下位领域的能量造成了事象变移，使地球(游戏中所谓的“失落耶路撒冷”)几乎完从从宇宙中“消失”，人类因而被迫逃亡，离开地球。
　　到了四千年多后，在故事开始前十五的T.C.4753年，米尔奇亚行星(Miltia)爆发了所谓的米尔奇亚冲突事件，在此次事件当中，米尔奇亚行星的人类疑似遭到了格诺西斯(Gnosis)的攻击，并在冲突事件后消失，但事件的真相却因为米尔奇亚的消失而不为人知。在事件后，启动原始索哈尔（后来人类制造出了十二具索哈尔模拟体，因此原有的索哈尔就被称之为原始索哈尔）所需的神之语言、原始索哈尔的研究成果、米尔奇亚的U.M.N.座标等事物，都被封存在Y资料当中，而Y资料又被封存在百式观测用合成人(Relian)M.O.M.O.的意识内，然而这么做却引起了各方势力对M.O.M.O.的争夺，因此星团联邦政府(游戏中统治各行星的政府，英文名Galaxy Federation)雇了一个名叫Ziggurat 8的生化人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的安全。
　　另一方面，在米尔奇亚冲突事件结束后的十几年，也就是大约在游戏EPI开始的时候，当时最大的企业贝克达公司以对抗格诺西斯侵扰的名义，进行对格诺西斯用战斗兵器KOS-MOS的开发计划，但和当时多使用合成人(Relian)与生化人(Cyborg)的情况所不同的是，KOS-MOS是个纯粹的机械制品。另一方面，在EPI开始时，参与KOS-MOS开发计划的贝克达公司第一开发局研究人员卯月紫苑，正乘着当时载有还没正式启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进行旅途。但没想到其太空船却被冲著索哈尔而来的格诺西斯所攻击，而KOS-MOS也在此时突然启动，卯月紫苑因而被卷入一连串和格诺西斯及索哈尔有关的阴谋，以及会改变人类命运的事件当中……

　　柴木耕太（高桥信 配音）是一位非常平凡的男子高中生，性格木讷的他向来就没有什么女生缘，一直过着形单影只的生活。一次偶然中，耕太得到了一本魔导书，通过这本魔导书，耕太召唤出了名为璐璐萌（三森铃子 配音）的魔女。璐璐萌是一个可以实现别人愿望的魔女，但是对方必须付出生命作为交换，可是，因为违反了魔界的规定，璐璐萌被开除了魔籍，不仅契约失效，而且无家可归。
　　善良的耕太收留了璐璐萌，就这样两个人开始了吵吵闹闹的同居生活，和他们一起的，还有璐璐萌的黑猫使魔奇洛（福圆美里 配音）。热热闹闹的每一天拉开了序幕。