為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。

　　宇宙帝国“残虐”的舰队突然进攻地球，为了守护爱与梦、和平与人类的笑容，34支超级战队集结迎战，成功将残虐击退，但力量也从此消失。
　　时间流逝，残虐再次侵略地球。此时，为寻找最大宝藏的5个宇宙海贼来到了地球，并举起反对残虐的旗帜，他们就是海贼战队豪快者！

故事主要讲述了在古老而遥远的泛古大陆，人类与恐龙和谐共处。但随着大陆的守护神----“龙神”的力量减弱，以瑞鹰为首的邪恶势力打破了和平。龙神为了拯救泛古大陆，将自己的力量封存在四块龙晶体，传说谁得到这四块龙晶体，就能得到无尚的力量，统治整个泛古大陆。而地球少年龙翔担起了重新恢复泛古大陆和平的重任。正反双方的龙晶体争夺战一触即发……

　　秦统一中国后，三代相韩的韩国世家子弟张良，为替韩国报仇，准备策划一场刺杀秦始皇的“斩首行动”。但他们的预谋被当局的廷尉府察觉，在张良前往荥阳向韩国王孙和韩国的遗老们汇报行动计划时，他们遭到了廷尉府伏哨的突袭，然而张良却侥幸逃脱。原因是韩王孙一直以卧薪尝胆的越王勾践为榜样，他要与会者每人吃一颗蛇胆，以示光复韩国的决心。身体赢弱的张良吃了性寒的蛇胆后，马上感到肚子不适，在他如厕时，廷尉府的伏哨冲杀进来，他在厕所躲过此劫。
　　张良在功成名就后，前往黄石岗祭拜老师黄石公时，意外遇见曾和他生死与共的西门雁——西门雁是在韩王孙被项羽封为韩王后，想封她为王妃时远走高飞的。两位有情人似乎有许多话要说，又不知从何说起，他们沉默地相视良久，西门雁就微微一笑，飘然而去，让张良心中留下那值得永远回忆的惆怅……

　　在同伴的眼中，瓜生新吾（水岛大宙 配音）是一个乐于助人的好好先生，而今年，新吾所就读的各务台私立学园即将和当地有名的结姬私立女子学园合并，而包括新吾在内的数十名学生，则被预先送往女校习惯未来的学习生活。面对着汹涌而来的，身穿洁白校服的纯洁女孩子们，有些羞涩的新吾会遇到怎 样的浪漫情缘呢？
　　个性傲娇专横的大小姐濑名爱理（小野凉子 配音），温柔可人沉默寡言的文学少女瓜生樱乃（後藤麻衣 配音），居家型混血少女安洁莉娜（壱智村小真 配音），个头迷你性格又有些天然呆的自然系学姐天羽美羽（松田理沙 配音），在和这些从未和男孩子打过交道的女孩子们交往的同时，新吾也找到了属于自己的，小小的，纯洁的爱情。