在防卫队长官·四之宫功的判断下，日比野卡夫卡逃过了被做成武器的命运，但依然处于被关押状态。在第三部队的新人们接到调动命令，纷纷赶赴各自要去往的新部队时，率领第一部队的最强者·鸣海弦出现在了卡夫卡面前。 鸣海表示不需要作为队员的卡夫卡，为了让他认可自己，卡夫卡必须直面“怪兽8号”那过于强大的力量。但与此同时，“怪兽9号”的威胁也在暗中逼近…
3022年，蔚蓝星被外星文明入侵，无数的战争机器通过传送站点来到了这里，战争机器疯狂缩小搜索范围，夏执序正在抵抗某种侵蚀......宇宙联邦派遣的队伍——阿尔法-300，同时出现在他的眼前。 “你能想象的魔法或者高等文明科技，其实是存在的。” 陈星瑶说出了这句话，她自称来自宇宙联邦纠察队——用可视化科技面板进行任务沟通，物品收纳，技能使用。 在接二连三的险情中，夏执序发现很多疑点，决定加入阿尔法-300，去变的更强，去探查那个真相。
